Магистерски студии до 2012 година
Едногодишни магистерски студии (4+1)
Студиски програми пренесени од Институтот за информатика на ПМФ
Студиски програми пренесени од Институтот за компјутерска техника и информатика на ФЕИТ
Двогодишни магистерски студии (3+1+1)
Дипломите за студентите кои дипломирале на прв и втор циклус (додипломски и магистерски студии) се доделуваат на прославата на денот на ФИНКИ.